MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016112	GCG	2	6	90012	90017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403464
1502	NC_016112	GTAA	2	8	90018	90025	50 %	25 %	25 %	0 %	357403464
1503	NC_016112	TCG	3	9	90073	90081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403464
1504	NC_016112	A	6	6	90093	90098	100 %	0 %	0 %	0 %	357403464
1505	NC_016112	GGC	2	6	90144	90149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403464
1506	NC_016112	A	8	8	90185	90192	100 %	0 %	0 %	0 %	357403464
1507	NC_016112	ATT	2	6	90218	90223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403464
1508	NC_016112	CG	3	6	90247	90252	0 %	0 %	50 %	50 %	357403464
1509	NC_016112	CG	3	6	90276	90281	0 %	0 %	50 %	50 %	357403464
1510	NC_016112	CGG	2	6	90317	90322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403464
1511	NC_016112	AAGGC	2	10	90361	90370	40 %	0 %	40 %	20 %	357403464
1512	NC_016112	GCA	2	6	90419	90424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403464
1513	NC_016112	TGA	2	6	90487	90492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403465
1514	NC_016112	GCA	2	6	90532	90537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403465
1515	NC_016112	TGA	2	6	90555	90560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403465
1516	NC_016112	CAG	2	6	90737	90742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403465
1517	NC_016112	A	6	6	90851	90856	100 %	0 %	0 %	0 %	357403465
1518	NC_016112	AGA	2	6	90968	90973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403466
1519	NC_016112	A	6	6	91025	91030	100 %	0 %	0 %	0 %	357403466
1520	NC_016112	TTG	2	6	91381	91386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403467
1521	NC_016112	ATT	2	6	91387	91392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403467
1522	NC_016112	TTGTT	2	10	91406	91415	0 %	80 %	20 %	0 %	357403467
1523	NC_016112	GGGCG	2	10	91452	91461	0 %	0 %	80 %	20 %	357403467
1524	NC_016112	CGG	2	6	91478	91483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403467
1525	NC_016112	GAC	2	6	91519	91524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403467
1526	NC_016112	AATT	2	8	91598	91605	50 %	50 %	0 %	0 %	357403468
1527	NC_016112	GCC	2	6	91657	91662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403468
1528	NC_016112	TGGG	2	8	91678	91685	0 %	25 %	75 %	0 %	357403468
1529	NC_016112	GAA	2	6	91858	91863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403468
1530	NC_016112	CGA	2	6	91904	91909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403469
1531	NC_016112	CTT	2	6	92005	92010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403469
1532	NC_016112	GAT	2	6	92075	92080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403469
1533	NC_016112	T	6	6	92103	92108	0 %	100 %	0 %	0 %	357403469
1534	NC_016112	T	6	6	92385	92390	0 %	100 %	0 %	0 %	357403469
1535	NC_016112	TTGGC	2	10	92395	92404	0 %	40 %	40 %	20 %	357403469
1536	NC_016112	ATC	2	6	92505	92510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403469
1537	NC_016112	TTG	2	6	92550	92555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403469
1538	NC_016112	ATT	2	6	92603	92608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403469
1539	NC_016112	T	6	6	92745	92750	0 %	100 %	0 %	0 %	357403470
1540	NC_016112	CAA	2	6	92893	92898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403470
1541	NC_016112	CAT	2	6	92923	92928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403470
1542	NC_016112	ATC	2	6	92963	92968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403470
1543	NC_016112	GCC	2	6	93022	93027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403470
1544	NC_016112	CAA	2	6	93040	93045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403470
1545	NC_016112	TCG	2	6	93059	93064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403470
1546	NC_016112	TGA	2	6	93123	93128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403470
1547	NC_016112	ATA	2	6	93150	93155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403470
1548	NC_016112	GTGG	2	8	93251	93258	0 %	25 %	75 %	0 %	357403470
1549	NC_016112	TTAA	2	8	93275	93282	50 %	50 %	0 %	0 %	357403470
1550	NC_016112	AGT	2	6	93299	93304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403470
1551	NC_016112	GTT	2	6	93396	93401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403471
1552	NC_016112	TTG	2	6	93424	93429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403471
1553	NC_016112	ATC	2	6	93438	93443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403471
1554	NC_016112	AGT	2	6	93448	93453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403471
1555	NC_016112	TTG	2	6	93472	93477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403471
1556	NC_016112	TCGAC	2	10	93486	93495	20 %	20 %	20 %	40 %	357403471
1557	NC_016112	ATTGTT	2	12	93537	93548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	357403471
1558	NC_016112	AAT	2	6	93595	93600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403471
1559	NC_016112	T	8	8	93685	93692	0 %	100 %	0 %	0 %	357403471
1560	NC_016112	TA	3	6	93788	93793	50 %	50 %	0 %	0 %	357403471
1561	NC_016112	GC	3	6	93962	93967	0 %	0 %	50 %	50 %	357403471
1562	NC_016112	ATTAC	2	10	94013	94022	40 %	40 %	0 %	20 %	357403471
1563	NC_016112	GGAG	2	8	94045	94052	25 %	0 %	75 %	0 %	357403471
1564	NC_016112	GCA	2	6	94171	94176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403472
1565	NC_016112	AAGC	2	8	94177	94184	50 %	0 %	25 %	25 %	357403472
1566	NC_016112	ATC	2	6	94292	94297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403472
1567	NC_016112	CAT	2	6	94343	94348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403472
1568	NC_016112	TGC	2	6	94369	94374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403472
1569	NC_016112	TCT	2	6	94380	94385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403472
1570	NC_016112	A	6	6	94395	94400	100 %	0 %	0 %	0 %	357403472
1571	NC_016112	GGC	2	6	94441	94446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403472
1572	NC_016112	GGC	2	6	94558	94563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403472
1573	NC_016112	AGC	2	6	94628	94633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403472
1574	NC_016112	CCT	2	6	94677	94682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403472
1575	NC_016112	TTG	3	9	94793	94801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403472
1576	NC_016112	TTG	2	6	94844	94849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403472
1577	NC_016112	GA	3	6	94886	94891	50 %	0 %	50 %	0 %	357403472
1578	NC_016112	GACGAG	2	12	94923	94934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357403472
1579	NC_016112	GC	3	6	95512	95517	0 %	0 %	50 %	50 %	357403473
1580	NC_016112	ATC	2	6	95683	95688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403473
1581	NC_016112	CG	3	6	95717	95722	0 %	0 %	50 %	50 %	357403473
1582	NC_016112	T	6	6	95728	95733	0 %	100 %	0 %	0 %	357403473
1583	NC_016112	TTTG	2	8	95766	95773	0 %	75 %	25 %	0 %	357403473
1584	NC_016112	CGC	2	6	95841	95846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403473
1585	NC_016112	TGC	2	6	95952	95957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403473
1586	NC_016112	ATTT	2	8	95984	95991	25 %	75 %	0 %	0 %	357403474
1587	NC_016112	GAT	2	6	96004	96009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403474
1588	NC_016112	T	6	6	96043	96048	0 %	100 %	0 %	0 %	357403474
1589	NC_016112	TTC	2	6	96106	96111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403474
1590	NC_016112	A	6	6	96130	96135	100 %	0 %	0 %	0 %	357403474
1591	NC_016112	TCGC	2	8	96137	96144	0 %	25 %	25 %	50 %	357403474
1592	NC_016112	TCG	2	6	96203	96208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403474
1593	NC_016112	GCT	2	6	96215	96220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403474
1594	NC_016112	GTTT	2	8	96260	96267	0 %	75 %	25 %	0 %	357403474
1595	NC_016112	ACC	2	6	96316	96321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403474
1596	NC_016112	A	7	7	96323	96329	100 %	0 %	0 %	0 %	357403474
1597	NC_016112	AAT	2	6	96475	96480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403475
1598	NC_016112	GTT	2	6	96490	96495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403475
1599	NC_016112	ATT	2	6	96536	96541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403475
1600	NC_016112	CGA	2	6	96600	96605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403475
1601	NC_016112	TGA	2	6	96609	96614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403475
1602	NC_016112	CGG	2	6	96619	96624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403475
1603	NC_016112	A	7	7	96625	96631	100 %	0 %	0 %	0 %	357403475
1604	NC_016112	CGGC	2	8	96633	96640	0 %	0 %	50 %	50 %	357403475
1605	NC_016112	GTT	2	6	96646	96651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403475
1606	NC_016112	GGC	2	6	96736	96741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403475
1607	NC_016112	T	8	8	96765	96772	0 %	100 %	0 %	0 %	357403475
1608	NC_016112	TG	3	6	96974	96979	0 %	50 %	50 %	0 %	357403475
1609	NC_016112	TGA	2	6	96981	96986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403475
1610	NC_016112	TAT	3	9	96990	96998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403475
1611	NC_016112	GAG	2	6	97040	97045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403475
1612	NC_016112	CGG	2	6	97239	97244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403476
1613	NC_016112	TTC	2	6	97248	97253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403476
1614	NC_016112	GCGTGC	2	12	97263	97274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357403476
1615	NC_016112	AAAT	2	8	97372	97379	75 %	25 %	0 %	0 %	357403476
1616	NC_016112	CGC	2	6	97442	97447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403476
1617	NC_016112	TGT	2	6	97477	97482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403476
1618	NC_016112	CGG	2	6	97520	97525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403476
1619	NC_016112	CATT	2	8	97586	97593	25 %	50 %	0 %	25 %	357403476
1620	NC_016112	CTGAAA	2	12	97612	97623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	357403476
1621	NC_016112	GTCG	2	8	97634	97641	0 %	25 %	50 %	25 %	357403476
1622	NC_016112	CGT	2	6	97763	97768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403476
1623	NC_016112	TAA	2	6	97782	97787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403476
1624	NC_016112	GAAATG	2	12	97853	97864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	357403476
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1626	NC_016112	ATG	2	6	97911	97916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403476
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1748	NC_016112	GTC	2	6	104822	104827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403482
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1750	NC_016112	GGC	2	6	104908	104913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403482
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1992	NC_016112	CCG	2	6	120695	120700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403496
1993	NC_016112	GCT	2	6	120710	120715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403496
1994	NC_016112	TGGG	2	8	120744	120751	0 %	25 %	75 %	0 %	357403496
1995	NC_016112	AT	3	6	120780	120785	50 %	50 %	0 %	0 %	357403496
1996	NC_016112	AGTCG	2	10	120809	120818	20 %	20 %	40 %	20 %	357403496
1997	NC_016112	CGG	2	6	120831	120836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403496
1998	NC_016112	ATAG	2	8	120841	120848	50 %	25 %	25 %	0 %	357403496
1999	NC_016112	TGAAAA	2	12	121111	121122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	357403497
2000	NC_016112	ATG	2	6	121443	121448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403497

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